Le système des Nations Unies au Burundi (SNU) est dirigé par une équipe dont le leadership est basé sur la responsabilité mutuelle des résultats du SNU dans le pays. La fonction de coordination est renforcée et chapeautée par la Coordonnatrice résidente des Nations Unies au Burundi, représentante désignée du Secrétaire général pour les opérations de développement.
L’équipe de pays travaille ensemble, à travers l'approche « Unis dans l'action », afin de répondre plus efficacement aux priorités de développement et besoins humanitaires, suivant le mandat des Nations Unies. Actuellement, le système des Nations Unies au Burundi est formé de 13 agences, fonds et programmes résidents.
Afin de capitaliser et renforcer les synergies, des programmes conjoints sont mis en œuvre dans le pays. Ces programmes sont développés par des Groupes de résultat en partenariat avec les ministères sectoriels. Ils sont l’occasion pour les agences des Nations Unies de réunir leur expertise sur la base de leur avantage comparatif afin de contribuer conjointement aux priorités et stratégies nationales de développement.